MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	ATTG	2	8	40	47	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021176	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021176	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021176	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021176	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021176	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021176	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021176	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021176	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021176	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021176	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
12	NC_021176	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	488652560
13	NC_021176	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
14	NC_021176	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
15	NC_021176	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	488652560
16	NC_021176	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
17	NC_021176	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	488652560
18	NC_021176	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
19	NC_021176	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
20	NC_021176	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
21	NC_021176	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	488652560
22	NC_021176	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	488652560
23	NC_021176	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
24	NC_021176	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
25	NC_021176	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
26	NC_021176	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
27	NC_021176	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
28	NC_021176	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
29	NC_021176	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	488652560
30	NC_021176	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652560
31	NC_021176	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652560
32	NC_021176	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
33	NC_021176	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
34	NC_021176	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
35	NC_021176	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
36	NC_021176	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652560
37	NC_021176	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	488652560
38	NC_021176	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
39	NC_021176	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
40	NC_021176	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
41	NC_021176	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652560
42	NC_021176	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652560
43	NC_021176	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	488652560
44	NC_021176	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652560
45	NC_021176	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
46	NC_021176	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652560
47	NC_021176	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652560
48	NC_021176	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
49	NC_021176	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
50	NC_021176	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652560
51	NC_021176	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
52	NC_021176	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652560
53	NC_021176	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652560
54	NC_021176	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
55	NC_021176	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652560
56	NC_021176	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
57	NC_021176	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
58	NC_021176	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
59	NC_021176	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	488652560
60	NC_021176	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	488652560
61	NC_021176	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
62	NC_021176	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	488652560
63	NC_021176	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652560
64	NC_021176	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
65	NC_021176	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
66	NC_021176	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	488652560
67	NC_021176	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652560
68	NC_021176	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
69	NC_021176	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
70	NC_021176	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
71	NC_021176	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652561
72	NC_021176	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652561
73	NC_021176	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	488652561
74	NC_021176	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652561
75	NC_021176	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652561
76	NC_021176	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	488652561
77	NC_021176	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652561
78	NC_021176	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
79	NC_021176	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652561
80	NC_021176	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652561
81	NC_021176	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652561
82	NC_021176	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
83	NC_021176	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	488652561
84	NC_021176	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652561
85	NC_021176	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
86	NC_021176	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	488652561
87	NC_021176	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	488652561
88	NC_021176	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652561
89	NC_021176	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
90	NC_021176	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652562
91	NC_021176	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	488652562
92	NC_021176	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652562
93	NC_021176	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652562
94	NC_021176	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	488652562
95	NC_021176	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
96	NC_021176	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
97	NC_021176	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	488652562
98	NC_021176	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652562
99	NC_021176	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	488652562
100	NC_021176	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
101	NC_021176	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652562
102	NC_021176	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652562
103	NC_021176	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
104	NC_021176	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652562
105	NC_021176	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652562
106	NC_021176	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
107	NC_021176	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	488652562
108	NC_021176	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	488652562
109	NC_021176	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652562
110	NC_021176	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
111	NC_021176	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	488652562
112	NC_021176	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
113	NC_021176	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652562
114	NC_021176	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
115	NC_021176	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	488652562
116	NC_021176	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652562
117	NC_021176	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	488652562
118	NC_021176	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
119	NC_021176	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652562
120	NC_021176	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021176	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	488652563
122	NC_021176	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652563
123	NC_021176	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652563
124	NC_021176	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652563
125	NC_021176	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	488652563
126	NC_021176	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	488652563
127	NC_021176	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652563
128	NC_021176	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652563
129	NC_021176	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652563
130	NC_021176	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652563
131	NC_021176	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	488652563
132	NC_021176	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	488652563
133	NC_021176	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652563
134	NC_021176	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488652563
135	NC_021176	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652563
136	NC_021176	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652563
137	NC_021176	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652563
138	NC_021176	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488652563
139	NC_021176	A	7	7	5924	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021176	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021176	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	488652564
142	NC_021176	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652564
143	NC_021176	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652564
144	NC_021176	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	488652564
145	NC_021176	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
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151	NC_021176	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	488652564
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155	NC_021176	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
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162	NC_021176	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652564
163	NC_021176	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	488652564
164	NC_021176	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
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166	NC_021176	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021176	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021176	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021176	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021176	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_021176	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_021176	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652565
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177	NC_021176	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652565
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192	NC_021176	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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203	NC_021176	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_021176	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	488652569
249	NC_021176	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_021176	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_021176	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021176	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021176	A	6	6	11424	11429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021176	T	6	6	11430	11435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021176	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_021176	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021176	A	8	8	11499	11506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021176	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021176	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652570
260	NC_021176	ATT	2	6	11603	11608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652570
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264	NC_021176	GCC	2	6	11814	11819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652570
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268	NC_021176	GAA	2	6	11953	11958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652570
269	NC_021176	GAA	2	6	11962	11967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652570
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398	NC_021176	GTT	2	6	17710	17715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
399	NC_021176	GTT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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